Jeho otec, Sir Nicholas Bacon, pochádzal z nižšej šľachty a pôsobil ako vysoký štátny úradník. Okrem iného mal aj titul lorda strážcu pečate. Matka, druhá manželka N. Bacona - Anna Cookova, bola spriaznená s W. Cecilom (lord Burghley), ktorý bol jedným z najvýznamnejších úradníkov v štáte - lord strážca pokladu. Francis Bacon vyrastal v hojnosti a dostatku. Bol pokladaný za nadané dieťa. Už po jeho narodení sa počítalo s tým, že jedného dňa nastúpi na nejaké významné miesto v službách štát...